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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

北京科协：建立国际科技组织联络机制******

　　光明日报北京1月9日电 记者詹媛9日从北京市科学技术协会获悉，目前该协会建立了国际科技组织联络机制，促进首都科技界与国际摄影测量与遥感学会、国际计算力学协会等20余家重点国际科技组织开展政策交流、信息共享和业务合作。在吸引海外科技人才服务科技经济发展方面，北京市科协目前已认定了首批30家首都海智基地，推荐5项境外职业资格纳入《北京市境外职业资格认可目录（2.0版）》。

　　根据清华大学产业发展与环境治理研究中心与施普林格·自然集团近日发布的《国际科技创新中心指数2022》，北京位列全球第三名，在创新生态指标上显著提升。创新生态的改善离不开广泛深入的国际交流，2022年，北京市科协致力于推动首都科技界开展国际科技交流，拓展全球合作网络，链接国际创新资源，不断扩大“国际朋友圈”。

　　据了解，北京市科协在建设国际组织集聚区、发起成立国际科技组织、支持首都专家学者在国际科技组织任职履职等方面，积极做好配合、联络、协调工作。聚焦前沿领域和青年科技群体，北京市科协还举办了北京科技交流学术月、首都前沿学术成果系列报告会等品牌活动，鼓励支持市级学会等举办约60场国际科技交流活动。北京市科协还支持吸引优质境外科技类非政府组织在京设立代表机构，协助重点国际组织，申请享受在京落户便利化政策。

　　北京市科协打造首都海智平台，以国家海外人才离岸创新创业基地（北京经济技术开发区）为依托，持续推动海淀区、昌平区、大兴区建立生物医药人才项目离岸基地；设立麒麟科学技术奖（海外人才类）国际合作奖。北京市科协还开展了工程师资格国际互认北京试点工作，以及优秀工程人才职业生涯全周期服务。

　　北京市科协还以科学为纽带，构筑中外友谊桥梁，联系55家高校科协，为促进“一带一路”科技工作者民心相通而努力，举办了“一带一路”中巴科技与经济合作论坛、“一带一路”建筑类大学国际联盟成立五周年纪念大会暨建筑类高等教育论坛等。

　　《光明日报》（ 2023年01月10日 16版）

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）